Когда решался вопрос о распаде СССР, Ленинградский городской совет народных депутатов 28 июня 1991 года принял проект нового устава города Ленинграда. Среди прочего в документе предлагалась городская символика. Согласно проекту, флаг представлял собой бело-голубо-красное полотнище с трёхглавым орлом в центре — разные головы символизировали законодательную, исполнительную и судебную ветви власти.
Источник:Википедия / Трёхглавый орёл